Molecular genetic analysis of the genome of Orthohantavirus puumalaense strains identified in the Kirov region

Proceeding
DOI: 10.31483/r-138807
Open Access
All-Russian scientific conference with International Participation «Fundamental and applied research for key propriety areas of bioecology and biotechnology»
Creative commons logo
Published in:
All-Russian scientific conference with International Participation «Fundamental and applied research for key propriety areas of bioecology and biotechnology»
Authors:
Iurii N. Davidiuk 1 , Daria S. Gubarets 2
Work direction:
Молекулярная биология, генетика, микробиология
Pages:
36-41
Received: 19 May 2025

Rating:
Article accesses:
105
Published in:
Информрегистр РИНЦ
1 Nauchno-klinicheskii tsentr pretsizionnoi i regenerativnoi meditsiny FGAOU VO "Kazanskii (Privolzhskii) federal'nyi universitet"
2 Kazan Federal University
For citation:
Davidiuk I. N., & Gubarets D. S. (2025). Molecular genetic analysis of the genome of Orthohantavirus puumalaense strains identified in the Kirov region. Fundamental and applied research for key propriety areas of bioecology and biotechnology, 36-41. Чебоксары: PH "Sreda". https://doi.org/10.31483/r-138807

Abstract

Проведен молекулярно-генетический анализ нуклеотидных последовательностей участков трех сегментов генома штаммов Orthohantavirus puumalaense (PUUV), выявленных у рыжих полёвок в Кировской области. Установлено, что штаммы принадлежат к сублинии East-FIN финской генетической линии PUUV.

Acknowledgments

Работа выполнена в рамках Программы стратегического академического лидерства Казанского (Приволжского) федерального университета (Приоритет 2030).

References

  1. 1. Blinova E. Evolutionary Formation and Distribution of Puumala Virus Genome Variants, Russia / E. Blinova, A. Deviatkin, M. Makenov [et al.] // Emerging infectious diseases. 2023. Vol. 29. Pp. 1420–1424. DOI 10.3201/eid2907.221731. EDN BOADFE
  2. 2. Castel G. Phylogeography of Puumala orthohantavirus in Europe / G. Castel, F. Chevenet, M. Razzauti [et al.] // Viruses. 2019. Vol. 11. P. 679. DOI 10.3390/v11080679. EDN YYRSDB
  3. 3. Davidyuk Y. Prevalence of the Puumala orthohantavirus strains in the pre-kama area of the Republic of Tatarstan, Russia / Y. Davidyuk, A. Shamsutdinov, E. Kabwe [et al.] // Pathogens. 2020. Vol. 9. P. 540. DOI 10.3390/pathogens9070540. EDN TMAUFS
  4. 4. Jiang H. Hemorrhagic fever with renal syndrome: pathogenesis and clinical picture / H. Jiang, X. Zheng, L. Wang [et al.] // Frontiers in Cellular and Infection Microbiology. 2016. Vol. 6. P. 1. DOI 10.3389/fcimb.2016.00001. EDN YWLWKF
  5. 5. Kabwe E. Analysis of Puumala orthohantavirus genome variants identified in the territories of Volga federal district / E. Kabwe, W.Al Sheikh, A.F. Shamsutdinov [et al.] // Tropical Medicine and Infectious Disease. 2022. Vol. 7. P. 46. DOI 10.3390/tropicalmed7030046. EDN OWBQNB
  6. 6. Kumar S. MEGA12: Molecular Evolutionary Genetic Analysis version 12 for adaptive and green computing / S. Kumar, G. Stecher, M. Suleski [et al.] // Molecular Biology and Evolution. 2024. Vol. 41. P. 263. DOI 10.1093/molbev/msae263. EDN XJLZTL
  7. 7. Okonechnikov K. Unipro UGENE: a unified bioinformatics toolkit / K. Okonechnikov, O. Golosova, M. Fursov // Bioinformatics. 2012. Vol. 28. Pp. 1166–1167. DOI 10.1093/bioinformatics/bts091. EDN PDNJNV
  8. 8. Razzauti M. Microevolution of Puumala hantavirus in its host, the bank vole (Myodes glareolus): dis. M. Razzauti PhD; 24.02.12 / M. Razzauti, Haartman Institute Faculty of Medicine. Helsinki, 2012. 88 l.
  9. 9. Елбоева П.И. Молекулярно-генетический анализ нуклеотидных последовательностей генома Puumala orthohantavirus, выявленных в Республике Мордовия: сборник трудов конференции / П.И. Елбоева, Ю.Н. Давидюк // Фундаментальные и прикладные исследования по приоритетным направлениям биоэкологии и биотехнологии. – 2023. – С. 57–65. DOI 10.31483/r-106903. EDN WPSFEI
  10. 10. Зырянов П.М. Обзор численности носителей и переносчиков зоонозов, эпизоотической и эпидемиологической обстановки в Приволжском федеральном округе в 2024 г. и прогноз на I полугодие 2025 г. / П.М. Зырянов, А.Н. Матросов, А.В. Иванова // ФКУН «Российский противочумный институт «Микроб» [Электронный ресурс]. – Режим доступа: https://microbe.ru/files/PFO_rev2024_prog2025_I.pdf (дата обращения: 12.04.2025).
  11. 11. Геморрагическая лихорадка с почечным синдромом // Официальный портал органов власти Чувашской Республики [Электронный ресурс]. – Режим доступа: https://zivil.cap.ru/news/2025/03/17/gemorragicheskaya-lihoradka-s-pochechnim-sindromom (дата обращения: 12.04.2025).
  12. 12. Савицкая Т.А. Хантавирусные болезни: обзор эпидемиологической ситуации в мире. Анализ эпидемиологической ситуации по геморрагической лихорадке с почечным синдромом в Российской Федерации в 2023 г. и прогноз на 2024 г. / Т.А. Савицкая, А.В. Иванова, А.А. Зубова [и др.] // Проблемы особо опасных инфекций. – 2024. – С. 113–124. DOI 10.21055/0370-1069-2024-1-113–124. EDN WVTEWS

Comments(0)

When adding a comment stipulate:
  • the relevance of the published material;
  • general estimation (originality and relevance of the topic, completeness, depth, comprehensiveness of topic disclosure, consistency, coherence, evidence, structural ordering, nature and the accuracy of the examples, illustrative material, the credibility of the conclusions;
  • disadvantages, shortcomings;
  • questions and wishes to author.