En
Register Log in
  1. Main
  2. Conference
  3. Fundamental and applied research for key propriety...
  4. Molekuliarno-geneticheskaia differentsiatsiia podt...

Molekuliarno-geneticheskaia differentsiatsiia podtipov gerpesa HHV-6

Proceeding
All-Russian scientific conference «Fundamental and applied research for key propriety areas of bioecology and biotechnology»
Creative commons logo
Published in:
All-Russian scientific conference «Fundamental and applied research for key propriety areas of bioecology and biotechnology»
Authors:
Aleksei V. Solovev 1 , Iuliia A. Piataeva 2 , Aleksandr V. Baranov 3 , Anastasiia V. Khambikova 3
Work direction:
Молекулярная биология (молекулярная генетика, генная инженерия, микробиология, медицинская микробиология, биомедицина, геномика, транскриптомика, протеомика, разработка ПЦР-тест-систем, филогенетика, иммуногенетика, микробиологический синтез ферментов и др.)
Pages:
21-26
Received: 17 May 2019

Rating:
Article accesses:
2855
Published in:
РИНЦ
1 FSBEI of HE "Samara State Medical University" of Ministry of Health of Russian Federation
2 Ulyanovsk State Pedagogical University named after I. N. Ulyanov
3 Nauchno-issledovatel'skii tsentr fundamental'nykh i prikladnykh problem bioekologii i biotekhnologii FGBOU VO "Ul'ianovskii gosudarstvennyi pedagogicheskii universitet im. I.N. Ul'ianova"
For citation:
Solovev A. V., Piataeva I. A., Baranov A. V., & Khambikova A. V. (2019). Molekuliarno-geneticheskaia differentsiatsiia podtipov gerpesa HHV-6. Fundamental and applied research for key propriety areas of bioecology and biotechnology, 21-26. Чебоксары: PH "Sreda".

Abstract

В работе проведен биоинформационный анализ геномов вируса 6-го типа с целью выявления участков, которые могут быть использованы для молекулярно-генетической диагностики подтипов А и B. В качестве таргетного для диагностики участка выбран фрагмент гена U31. Разработана молекулярно-генетическая система на основе полимеразной цепной реакции в режиме «реального времени», а также проведена ее апробация.

References

  1. 1. Никольский М.А. Инфекция, вызванная вирусом герпеса человека 6 типа, у детей: современное состояние проблем // Российский вестник перинатологии и педиатрии. – 2008. – №2. – С. 93–97.
  2. 2. Никольский М.А. Хромосомно-интегрированный вирус герпеса 6 типа / М.А. Никольский, В.С. Голубцова // Инфекция и иммунитет. – 2015. – Т. 5. – №1. С. 7–14.
  3. 3. Chan P.K. Prevalence discribution of human herpesvirus 6 variants A and В in adult human brain / P.K. Chan, H.K. Ng, M. Hui, A.F. Cheng // Journal of Medical Virology. – 2004. – №64. – P. 42–46.
  4. 4. Dominguez, G. Human herpesvirus 6B genome sequence: coding content and comparison with human herpesvirus 6A / G. Dominguez, T.R. Dambaugh, F.R. Stamey, S. Dewhurst, N. Inoue, P.E. Pellett // Journal of Virology. – 1999. – Vol. 73 (10). – Р. 8040–8052.
  5. 5. Ihira, M. Development of real-time RT-PCR assays for detection of three classes of HHV-6A gene transcripts / M. Ihira, A. Urashima, H. Miura, F. Hattori, Y. Kawamura, K. Sugata, T. Yoshikawa // Journal of Medical Virology. – 2017. doi: 10.1002 / jmv.24862
  6. 6. Komaroff A.L. Summary of the 10th International Conference on Human Herpesviruses-6 and -7 (HHV-6A, -6B, and HHV-7) / A.L. Komaroff, M. Boeckh, E. Eliason, T. Phan, B.B. Kaufer // Journal of Medical Virology. – 2018. – Vol. 90 (4). – P. 625–630. doi: 10.1002/jmv.25004
  7. 7. Nei M. Molecular Evolution and Phylogenetics / M. Nei, S. Kumar. – Oxford University Press, 2000. – 333 p.
  8. 8. Reddy S. Quantitative Detection and Differentiation of Human Herpesvirus 6 Subtypes in Bone Marrow Transplant Patients by Using a Single Real-Time Polymerase Chain Reaction Assay/ S. Reddy, P. Manna // Biology of Blood and Marrow Transplantation. – 2005. – Vol. 11. – P. 530–541.
  9. 9. Wood, M.L. Chromosomally Integrated Human Herpesvirus 6: Models of Viral Genome Release from the Telomere and Impacts on Human Health / M.L. Wood, N.G. Royle // Viruses. – 2017. – Vol. 9 (7). – E184. doi: 10.3390/v9070184
  10. 10. Yalcin, S. Human herpesvirus 6 and human herpesvirus 7 infections in renaltransplant recipients and healthy adults in Turkey / S. Yalcin, T. Karpuzoglu, G. Suleymanlar, G. Mutlu, T. Mukai, T. Yamamoto, et al. //Archives of Virology. – 1994. – №136. – P. 183–190.
  11. 11. Yalcin, S. Prevalence of human herpesvirus 6 variants A and В in patients with chronic fatigue syndrome / S. Yalcin, H. Kuratsune, K. Yamaguchi, T. Kitani, K. Yamanishi // Microbiology and Immunology. – 1994. – №38. – P. 587–590.
  12. 12. Yoshikawa, T. Evaluation of active human herpesvirus 6 infection by reverse transcription-PCR / T. Yoshikawa, S. Akimoto, N. Nishimura, T. Ozaki, M. Ihira, M. Ohashi, M. Morooka, S. Suga, Y. Asano, M. Takemoto, Y. Nishiyama // Journal of Medical Virology. – 2003. – Vol. 70 (2). – P. 267–272.

Comments(0)

When adding a comment stipulate:
  • the relevance of the published material;
  • general estimation (originality and relevance of the topic, completeness, depth, comprehensiveness of topic disclosure, consistency, coherence, evidence, structural ordering, nature and the accuracy of the examples, illustrative material, the credibility of the conclusions;
  • disadvantages, shortcomings;
  • questions and wishes to author.